2015年3月5日，《那年那兔那些事兒》动画版开始在网络上播放，基本每两周更新一集，每季均为12话。[9]值得一提的是，动画播出后得到共青团中央与新华社官方微博的推荐。[10][11]

第一季之后，为纪念抗日战争胜利七十周年，特制番外篇之江阴海战。

第二季正式开播前，有第0集，讲述主要角色美苏中三国国歌的由来。

第二季之后，番外篇之抗美援朝共5话，为电影《我的战争》作宣传。

2017年鸡年春节，番外篇之贺新春共2话，兔子和鹰酱合作相声拜年。

2020年10月31日，小安工作室[註 1]联合厦门翼下之风动漫特别推出《那年那兔那些事儿－－香港特别篇》。

2021年9月7日，四川省卫生健康宣教中心联合厦门翼下之风动漫特别推出《那年那兔那些事儿－－抗疫的故事》，既是致敬在疫情防控中作出奉献的每一个人，也是再次向大家呼吁：积极接种疫苗，守住来之不易的抗疫成果！

2021年9月30日，人民日报联合厦门翼下之风动漫特别推出《那年那兔那些事儿－－我的父辈》，为电影《我和我的父辈》作宣传。

第一季片尾曲是GALA乐队的《追梦赤子心》；第二季及抗美援朝番外篇第1话，片尾曲是南征北战NZBZ乐队的《骄傲的少年》；抗美援朝第2至第5话，及第三季片尾曲是许科的《飞－－致我们的星辰大海》；第四季片尾曲是午年_5ive的《留给明天的答卷》[註 2]；第五季，第五集片尾曲是《骄傲的少年》，第九集是《飞－－致我们的星辰大海》，第十、十一集是韩青青的《请你回答》（致王伟），其余集数片尾曲均采用顽乐团的《耀世微光》；第六季片尾曲是夏雨的《前进！无名者之歌》。